Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 CIRBP-227ENST00000590188 361 ntTSL 320■□□□□ 0.792e-8■□□□□ 9.4
GTF2F1P35269 CIRBP-203ENST00000444172 584 ntTSL 319.19■□□□□ 0.662e-8■□□□□ 9.4
GTF2F1P35269 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.736e-13■□□□□ 9.4
GTF2F1P35269 DDAH2-218ENST00000480913 937 ntTSL 521.03■□□□□ 0.963e-7■□□□□ 9.4
GTF2F1P35269 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.93e-7■□□□□ 9.4
GTF2F1P35269 DDAH2-219ENST00000483792 898 ntTSL 513.79□□□□□ -0.23e-7■□□□□ 9.4
GTF2F1P35269 TANGO2-226ENST00000490583 888 ntTSL 319.11■□□□□ 0.652e-6■□□□□ 9.4
GTF2F1P35269 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.275e-22■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 AHSA2-204ENST00000463681 453 ntTSL 525.87■■□□□ 1.735e-22■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.735e-22■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.445e-22■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.297e-7■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 ARL15-206ENST00000510591 804 ntTSL 55.01□□□□□ -1.617e-7■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.657e-7■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.657e-7■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 ITIH3-210ENST00000495622 920 ntTSL 517.04■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-7■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.741e-7■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.315e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 BAX-207ENST00000502487 1346 ntTSL 1 (best)29.09■■■□□ 2.255e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 AMN-203ENST00000558590 2772 ntTSL 224.18■■□□□ 1.465e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.455e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 EDC4-204ENST00000572221 5267 ntTSL 223.26■■□□□ 1.315e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 TMED9-202ENST00000505521 925 ntTSL 221.16■□□□□ 0.985e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.815e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.585e-28■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 BMP4-203ENST00000558489 605 ntTSL 316.6■□□□□ 0.255e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 TMED9-204ENST00000507723 1018 ntTSL 216.39■□□□□ 0.215e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 LAMA5-213ENST00000497053 723 ntTSL 315.67■□□□□ 0.15e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 TMED9-206ENST00000513799 772 ntTSL 212.73□□□□□ -0.375e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 TMED9-203ENST00000507578 144 ntTSL 53.57□□□□□ -1.845e-6■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 NOTUM-204ENST00000489218 972 ntTSL 221.02■□□□□ 0.968e-8■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 SFXN2-202ENST00000459894 2324 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-8■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 SFXN2-203ENST00000480358 2315 ntTSL 514.58□□□□□ -0.082e-8■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.472e-8■□□□□ 9.3
GTF2F1P35269 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.315e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.085e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-202ENST00000416138 552 ntTSL 420.86■□□□□ 0.935e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.935e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.915e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.815e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.745e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-211ENST00000452268 1448 ntTSL 518.83■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MAP3K11-206ENST00000527304 5605 nt18.77■□□□□ 0.65e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.575e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MAP3K11-203ENST00000524856 3787 ntTSL 218.47■□□□□ 0.555e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-215ENST00000478492 543 ntTSL 418.46■□□□□ 0.555e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.535e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.515e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 SLC22A23-212ENST00000497691 2555 ntTSL 1 (best)17.68■□□□□ 0.425e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-207ENST00000444759 2717 ntTSL 217.65■□□□□ 0.425e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.45e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-10■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MAP3K11-204ENST00000526293 571 ntTSL 416.97■□□□□ 0.315e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.295e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 BCAM-204ENST00000588714 723 ntTSL 216.71■□□□□ 0.275e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 216.69■□□□□ 0.262e-10■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 SLC22A23-207ENST00000467177 1221 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.195e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 216.05■□□□□ 0.162e-10■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.15e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MAP3K11-207ENST00000529839 561 ntTSL 415.48■□□□□ 0.075e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 SLC22A23-206ENST00000467144 542 ntTSL 415.19■□□□□ 0.025e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 SLC22A23-209ENST00000485307 1574 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.085e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.195e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 SLC22A23-211ENST00000496753 561 ntTSL 413.55□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 313.23□□□□□ -0.295e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-203ENST00000418735 594 ntTSL 413.1□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.352e-10■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-10■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-209ENST00000448075 701 ntTSL 512.3□□□□□ -0.445e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 ITPR2-203ENST00000451599 2577 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.495e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MOV10-205ENST00000465579 610 ntTSL 211.56□□□□□ -0.565e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-220ENST00000597150 2811 ntTSL 211.24□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.645e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MOV10-208ENST00000475429 582 ntTSL 311.05□□□□□ -0.645e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-201ENST00000354204 5253 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 HCG18-247ENST00000602698 573 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.685e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-218ENST00000487070 4937 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.695e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MOV10-217ENST00000496577 4312 ntTSL 210.5□□□□□ -0.735e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.735e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-204ENST00000420155 5028 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.735e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MOV10-206ENST00000468624 4689 ntTSL 510.3□□□□□ -0.765e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 KANSL3-213ENST00000475820 583 ntTSL 39.49□□□□□ -0.895e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 HCG18-248ENST00000602861 372 ntTSL 39.39□□□□□ -0.915e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-10■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 PLIN2-207ENST00000475923 1000 ntTSL 38.89□□□□□ -0.995e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 JMJD1C-207ENST00000489372 913 ntTSL 58.81□□□□□ -15e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.15e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 JMJD1C-205ENST00000469152 734 ntTSL 37.29□□□□□ -1.245e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 PLIN2-204ENST00000434144 623 ntTSL 36.44□□□□□ -1.385e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.475e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 MOV10-212ENST00000486416 347 ntTSL 55.82□□□□□ -1.485e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 PLIN2-206ENST00000472715 801 ntTSL 25.81□□□□□ -1.485e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.835e-6■□□□□ 9.2
GTF2F1P35269 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.98□□□□□ -1.935e-6■□□□□ 9.2
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