Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms