Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms