Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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