Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GCSHP23434 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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GCSHP23434 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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GCSHP23434 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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GCSHP23434 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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GCSHP23434 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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GCSHP23434 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GCSHP23434 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GCSHP23434 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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