Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CXCL2P19875 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL2P19875 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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