Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMD1P17707 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMD1P17707 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms