Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms