Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms