Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms