Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms