Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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