Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms