Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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