Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB2P05107 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms