Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms