Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms