Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN2O60636 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN2O60636 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms