Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms