Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms