Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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