Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms