Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IQCJ-SCHIP1C9J366 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IQCJ-SCHIP1C9J366 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms