Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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