Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms