Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP3K4Q9Y6R4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms