Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms