Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms