Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms