Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms