Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms