Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MLH3Q9UHC1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms