Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms