Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms