Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms