Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms