Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHPF2Q9P2E5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms