Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRFN1Q9P244 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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