Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HCN3Q9P1Z3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms