Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms