Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms