Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms