Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM4Q9C037 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms