Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms