Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms