Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms