Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms