Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LYSTQ99698 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms