Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP88Q99567 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms