Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms